BigWig on failivorming tihedate pidevate andmete kuvamiseks genoomibrauseri rajal, mis on loodud Wiggle (WIG) vormingust teisendamise teel. BigWigi vormingut kirjeldatakse UCSC Genome Bioinformaticsi veebisaidil ja Broad Institute failivormingu juhend pakub lisateavet.
Mis on bigWig-vorming?
BigWig-vorming on tihedate pidevate andmete kuvamiseks, mis kuvatakse graafikuna. BigWig-failid luuakse algselt WIG-tüüpi failidest, kasutades UCSC programmi wigToBigWig. Teise võimalusena saab bigWig-faile luua bedGraphi failidest, kasutades UCSC programmi bedGraphToBigWig.
Kuidas kasutada bigWig-faili?
Teisaldage vastloodud bigWig-fail (myBigWig.bw) veebijuurdepääsetavasse http, https või ftp asukohta. Kleepige URL kohandatud raja sisestamise vormi või looge kohandatud rada ühe rajarea abil. Kleepige kohandatud rajajoon kohandatud rajahalduse lehe tekstikasti.
Mis on bigWig lugu?
bigWig Tracks on rajad pidevate signaalide jaoks kogu genoomis. Need sobivad erinevate "toorete" katsetulemuste kuvamiseks, nagu ChIP-Seq signaalid, RNA-Seq signaalid jne.
Kuidas luua bigWig-faili?
Suurte failide loomiseks on mitu võimalust. See hõlmab tavaliselt. bam-fail vingerdamise rajaks (. wig) ja seejärel teisendada kõnniraja binaarseks bigwig-rajaks (.
