Selgitus: Ensüümid, nagu restriktsiooniensüümid, peavad tundma ära väga spetsiifilise järjestuse, et täita oma ülesannet. See seostub DNA-ga ainult ühes kindlas konfiguratsioonis. … Palindroomne järjestus suurendab ka võimalust, et mõlemad DNA ahelad katkevad.
Kuidas on palindroomid seotud restriktsiooniensüümidega?
Restriktsiooniensüümid lõikavad kaheahelalist DNA-d kindlates kohtades, põhinedes nendes kohtades leitud aluste mustril. Need ensüümid lõikavad ettearvatav alt mõlemad ahelad, kuna nende poolt äratuntavad järjestused on palindroomsed. See tähendab, et äratundmisjärjestused on mõlema DNA ahela identsete aluste lühike jada.
Kas kõik restriktsiooniensüümid lõikavad palindroome?
Enamik restriktsiooniensüüme lõikab oma palindroomsed äratundmisjärjestused asümmeetriliselt, jättes lõike mõlemale küljele üheahelalise üleulatuse (vt joonis 4, ülemine). Igas antud ensüümi äratundmiskohas on neil üleulatuvatel osadel ainulaadsed ja komplementaarsed järjestused.
Kas kõik piirangusaidid on palindroomid?
Piiramise-modifitseerimissüsteeme kasutatakse kaitsemehhanismina võõr-DNA sobimatu sissetungi vastu. Tavaliste II tüüpi restriktsiooniensüümide ja neile vastavate metülaaside äratundmisjärjestused on tavaliselt palindroomid.
Mida see tähendab, kui ensüüm on palindroomne?
Palindroomne jada on mõlemal küljel edasi- ja tagasisuunas ühesugune (vt pilti allpool). See tähendab, et ensüüm tunneb järjestuse ära olenemata sellest, kumm alt poolt ensüüm DNA-le läheneb Palindroomne järjestus suurendab ka võimalust, et mõlemad DNA ahelad katkevad.
