α-Amanitiinil on ebatavaliselt tugev ja spetsiifiline külgetõmme ensüümi RNA polümeraasi II vastu. Allaneelamisel ja maksarakkude poolt omastatuna seondub see ensüümiga RNA polümeraas II, põhjustades tõhus alt hepatotsüütide (maksarakkude) tsütolüüsi.
Kuidas amanitiin inhibeerib RNA polümeraasi?
α-Amanitiini inhibeerivad RNA polümeraasid II ja III
Amanitiin seondub kõrge spetsiifilisuse ja kõrge afiinsusega (Ki=3–4 nM) katalüütilise lähedal RNAP II aktiivne sait. See püüab kinni ensüümi konformatsiooni, mis takistab nukleotiidide inkorporeerimist ja transkripti translokatsiooni
Kuidas alfa-amanitiin mõjutab transkriptsiooni?
Alfa-amanitiin inhibeerib RNA polümeraas II (pol II), blokeerides transkriptsiooni initsiatsiooni ja pikenemiseOn näidatud, et see seob pol II sillaheeliksi all ja üle Rpb1 ja Rpb2 vahelise pilu (1). Enamik pol II jääkidest, mis tegelikult interakteeruvad, asuvad sillaspiraalil.
Mida alfa-amanitiin inhibeerib?
α-Amanitiin tapab rakke, inhibeerides RNA polümeraasi II (Pol II) ja sulgedes geenide transkriptsiooni.[1] α-Amanitiin sünteesitakse proproteiinina 34–35 aminohappe pikkustes ribosoomides ja seejärel lõhustatakse prolüüloligopeptidaasi (POP) alamperekonda kuuluva ensüümi abil spetsiifiliste proliinijääkide juurest.
Milline RNA polümeraas on alfa-amanitiini suhtes kõige tundlikum?
RNA polümeraas II on kõige tundlikum (50% inhibeerimine 1,0 kruusi alfa-amanitiini 1 ml kohta).