Kõik aminohapped leidub α-heeliksides, kuid glütsiin ja proliin on haruldased, kuna need destabiliseerivad α-heeliksit. Glütsiin on vabastatud paljudest steerilistest piirangutest , kuna sellel puudub β süsinik. … Proliin seevastu on liiga jäik.
Millist aminohapet alfa-heeliksis ei leidu?
Proliin ei leidu valkude alfa-spiraalses struktuuris, kuna sellel on eriline tsükliline struktuur (see on iminohape, mitte aminohape)m seda tüüpi sekundaarstruktuuril on konkreetne laius ja konkreetne aminohappejääkide arv / pööre. Seetõttu peetakse proliini alfa-spiraalseks katkestajaks.
Miks on glütsiin alfa-heeliksi purustaja?
Proliini ja glütsiini tuntakse mõnikord "heeliksimurdjatena" sest need häirivad α spiraalse selgroo konformatsiooni regulaarsust; aga mõlemal on ebaharilikud konformatsioonilised võimed ja neid leidub tavaliselt vaheldumisi.
Kus on glütsiin alfaheeliksis?
Heelix-pööre-heeliksi motiivil on kolm asendit, mis on väga konserveerunud. Alaniin leidub tavaliselt esimese α-spiraali positsioonis 5; glütsiin leitakse positsioonis 9, pöörde esimeses asendis; ja valiin või isoleutsiin leidub tavaliselt teises α-heeliksis 15. positsioonis.
Kas glütsiini jääke leidub valdav alt alfa-heeliksides?
Glütsiini oma paljude võimalike peamiste ahelate konformatsioonidega leitakse harva ka spiraalides. Teades, kui tõenäoline on aminohappe esinemine alfa-heeliksis (nn heeliksi kalduvus), on võimalik ennustada, kus heeliksid valgujärjestuses esinevad.