Trüpsiin lõhustab peptiidsideme arginiini karboksüülrühma või lüsiini karboksüülrühma ja külgneva aminohappe aminorühma vahel. Lõhustumine toimub aeglasem alt, kui lüsiini ja arginiini jäägid on järjestuses happeliste aminohapete või tsüstiini kõrval.
Kust trüpsiin aminohappeid lõhustab?
Trüpsiin lõhustab peptiide lüsiini ja arginiini aminohappejääkide C-terminaalsel küljel. Kui proliini jääk on lõhustamiskoha karboksüüli poolel, siis lõhustumist ei toimu.
Millist järjestust trüpsiin lõikab?
Trüpsiin lõhustab eranditult C-terminaalselt arginiini- ja lüsiinijääkidele Peaaegu kõik massispektromeetriapõhise proteoomika suuremahulised projektid kasutavad trüpsiini, et muuta valgu segud hõlpsamini analüüsitavateks peptiidideks populatsioonid.
Milliseid aminohappeid lõikavad trüpsiin ja kümotrüpsiin?
Trüpsiin vähendab lüsiini ja arginiini, samas kui kümotrüpsiin. lõikab türosiini, fenüülalaniini ja trüptofaani. Kuidas ensüüm teab, et seal lõikab? Pakkuge välja alternatiiv aspartaadile ja histidiinile katalüütilises triaadis.
Milliseid aminohappeid pepsiin lõhustab?
Pepsiin lõhustab peptiidsidemeid tsükliliste aminohappejääkide ( türosiin, fenüülalaniin ja trüptofaan) aminoterminaalsel küljel, lõhustades polüpeptiidahelad väiksemateks peptiidideks (Fange ja Grove, 1979).
